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引物设计的基本原则

日期:2025-05-04 01:37
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摘要: 引物设计的基本原则: 1、 引物长度:15-30 bp,常用为20 bp左右。 2、 引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C 过多易出现非特异条带。ATGC好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。 3、 引物内部不应出现互补序列。 4、两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3 ′端的互补重叠。 5、 引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。...

引物设计的基本原则:


1、  引物长度:15-30 bp,常用为20 bp左右。


2、 引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C 过多易出现非特异条带。ATGC好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。


3、 引物内部不应出现互补序列。

4、两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3 ′端的互补重叠。

5、 引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。

6、引物3‘端的碱基,特别是zui 末及倒数第个碱基,应严格要求配对,选择是G和C。


7、 引物的5 ′端可以修饰。如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素、荧光物质、地高辛标记,加入其它短序列,包括起始密码子、终止密码子等。